Có hơn 40 phụ loài sóc đỏ nhưng tình trạng một số phân loài vẫn chưa chắc chắn. Một nghiên cứu năm 1971 công nhận 16 phụ loài và đã được dùng làm cơ sở cho công tác phân loài sau đó.[6][7] Hiện tại có 23 phân loài được công nhận.[8]

• S. v. alpinus. Desmarest, 1822. (Đồng nghĩa: S. v. baeticus, hoffmanni, infuscatus, italicus, meridionalis, numantius, segurae hoặc silanus.)
• S. v. altaicus. Serebrennikov, 1928.
• S. v. anadyrensis. Ognev, 1929.
• S. v. arcticus. Trouessart, 1906. (Đồng nghĩa: S. v. jacutensis.)
• S. v. balcanicus. Heinrich, 1936. (Đồng nghĩa: S. v. istrandjae hoặc rhodopensis.)
• S. v. chiliensis. Sowerby, 1921.
• S. v. cinerea. Hermann, 1804.
• S. v. dulkeiti. Ognev, 1929.
• S. v. exalbidus. Pallas, 1778. (Đồng nghĩa: S. v. argenteus hay kalbinensis.)
• S. v. fedjushini. Ognev, 1935.
• S. v. formosovi. Ognev, 1935.
• S. v. fuscoater. Altum, 1876. (Đồng nghĩa: S. v. brunnea, gotthardi, graeca, nigrescens, russus hay rutilans.)
• S. v. fusconigricans. Dvigubsky, 1804
• S. v. leucourus. Kerr, 1792.
• S. v. lilaeus. Miller, 1907. (Đồng nghĩa: S. v. ameliae hay croaticus.)
• S. v. mantchuricus. Thomas, 1909. (Đồng nghĩa: S. v. coreae hay coreanus.)
• S. v. martensi. Matschie, 1901. (Đồng nghĩa: S. v. jenissejensis.)
• S. v. ognevi. Migulin, 1928. (Đồng nghĩa: S. v. bashkiricus, golzmajeri hoặc uralensis.)
• S. v. orientis. Thomas, 1906.[9]
• S. v. rupestris. Thomas, 1907
• S. v. ukrainicus. Migulin, 1928. (Synonym: S. v. kessleri.)
• S. v. varius. Gmelin, 1789.
• S. v. vulgaris. Linnaeus, 1758.[10] (Đồng nghĩa: S. v. albonotatus, albus, carpathicus, europaeus, niger, rufus hay typicus.)